شهد فرع الاحياء المجهرية في كلية الطب البيطري بجامعة بغداد مناقشة اطروحة الدكتوراه الموسومة (تحليل النشوء والتطور للفيروس الغدي المرتبط بالتهاب الكبد ذو الاجسام الاشتمالية في الدجاج) للطالبة اية رياض عبدالله.
وهدفت الدراسة للكشف الجزيئي والتقليدي عن الفيروس الغدي في الدجاج اللاحم وتقييم ضراوة العزلات الحقلية عن طريق التحليل الجزيئي لتسلسل النيوكليوتيدات للفيروس الغدي في الدجاج, حيث تضمنت هذه الدراسة جمع 75 عينة من الاكباد مشتبه بها مصابة بفيروس FAdv من مواقع مختلفة في العراق تتضمن ديالى وتكريت وكربلاء, مشيرا تراوح عمر الدجاج المشتبه في إصابته بالعدوى (25-45) يوما. تم حصاد أعضاء الكبد في الموقع ونقلها بشكل معقم لتخزينها في درجة حرارة -80 لمعالجة واكتشاف الجسيمات الفيروسية. وتم استخلاص الحمض النووي من العينات المجمعة (الكبد) بواسطة كت استخلاص الحمض النووي.
وتضمنت الاطروحة استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل التقليدي للكشف عن FAdV في العينات التي تم جمعها عن طريق تضخيم الجينات الأخرى Hexon A, Hexon B and Fiber .وكان تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) إيجابيًا للكشف عن FAdV في الاكباد التي تم جمعها بواسطة جينات أخرى. تم إرسال تسع عينات (أمبليكون) إلى كوريا (شركة ماكروجين) لاجراء تسلسلها بطريقة سانجر.
أظهرت نتائج BLAST أنها متطابقة وراثيًا مع جين F الموجود في FAdV – E و 8b مع القيمة المتوقعة 5.5 E-118 إلى 0 ، مع مصفوفة تشابه تتراوح من 75.62٪ إلى 87.26٪ ، ولكن مقارنة هذا الجين بين العزلات المدروسة فإنه يشكل تشابهًا شمل القسم المعزول 44 و 33 و 37 ليكون وثيق الصلة بالنوع E و 8b مما يشير إلى أن هذا الجين شديد التأثر بالعملية التطورية أثناء تطور الفيروس. وأظهر تجميع جينات الضراوة داخل الجينوم أن الجين fiber غطى 1684 نيوكليوتيد مع 102 من الأحماض الأمينية مع اتجاه عقارب الساعة يحمل أهدافًا متعددة لتقييد الإنزيمات.
أستنتجت هذه الدراسة وجود عزلات من الفيروس الغدي للطيور ذات عدوى مختلطة في نفس الطائر ، مع عزلات في الغالب FAdV-4 و FAdV-E و 8b. النوع 8b هو مشتق من E. تظهر الحلقات Loop1 و Loop2 تباينًا في تسلسل النوكليوتيدات بسبب المناطق شديدة التغير. ولوحظ استقرار جينات الألياف في الغالب. كان تفاعل الريل تايم PCR حساسًا وسريعًا للكشف عن الفيروسات الغدية للطيور وكان تفاعل البوليميراز المتسلسل التقليدي طريقة مناسبة لتشخيص الفيروس. وكانت أجنة الدجاج طريقة مناسبة لعزل الفيروس الغدي للطيور.
